Eigenschaften unserer professionell entwickelten Echtzeit-PCR Assays:

• Garantiert spezifische Primer (1 Ergebnis bei Schmelzkurvenanalyse)
• Garantierte Effizienz der Primer (>90% Effizienz)
• Primer frei von SNPs (Auf Anfrage können Primer auf SNPs geprüft werden)
• Flexible Entwicklung (Entwicklung entsprechend den individuellen Kundenanforderungen)
• Optimiert für Echtzeit-PCR
• Kurze Amplicons
• Template frei von Sekundärstrukturen
• Minimierung der Bildung von Primer-Dimeren
• Minimierung von Haarnadelstrukturen in Primern
• Optimierte Tm

Flexibilität bei der Entwicklung von Primern
Die Flexibilität, die wir unseren Kunden in Bezug auf die Entwicklung ihres Assays bieten können, ist eines der größten Vorteile unseres Entwicklungsservices. Wir berücksichtigen so den Wunsch unserer Kunden, nicht nur einzig die globale Expression zu messen, sondern beispielsweise herauszufinden, welche Spliceformen am zahlreichsten vorkommen und biologisch am relevantesten sind.

Unsere Experten für Forschung & Entwicklung sind in der Lage, Sie bei diesen Projekten zu unterstützen. Spezifische Anforderungen an das Assaydesign sind in den meisten Fällen im Listenpreis enthalten. Folgende Sonderwünsche können wir ohne Zusatzkosten erfüllen:

• Überspannen von mindesten einem Intron
• Nachweis eines spezifischen Exons
• Assay für den Nachweis von Gen „X“ ohne Nachweis des eng verwandten Gens „Y“
• Assay für ein einziges Exon für den Nachweis von cDNA und gDNA
• Platzierung des Assay in der Nähe des 3‘ Endes

Splicevarianten
Die Entwicklung von Assay zum Nachweis spezifischer Splicevarienten ist kostenlos. Allerdings liefern wir diese Assays zusammen mit einer Positivkontrolle aus, für die geringe Zusatzkosten berechnet werden. Sie profitieren jedoch in mehrfacher Hinsicht von dieser Positivkontrolle. Viele Splicevarienten, auf die in Veröffentlichungen hingewiesen wird oder die in den wichtigsten Sequenzdatenbanken referenziert sind, werden in bestimmten Geweben und unter bestimmten Bedingungen gar nicht oder nur schwach exprimiert. Unsere Positivkontrolle ermöglicht es Ihnen, sowohl eine Standardkurve zur Bestimmung der Anzahl der Genkopien anzufertigen als auch für Ihre Studie nicht relevante Splicevarianten ausschließen zu können. Es ist in vielen Fällen nicht möglich, ein Splicevarianten-Assay nur mittels cDNA aus unserer BioBank zu validieren. Dank der für unsere Kunden entwickelten Positivkontrolle sind wir daher in der Lage, das Assay fachgerecht zu validieren und so sicherzustellen, dass es auch bei ihnen im Laboreinsatz perfekt funktioniert.

Wie entwickeln wir die besten Primer?
Bei PrimerDesign stehen unsere Experten im Zentrum des Entwicklungsprozesses für Primer. Unser Team aus Wissenschaftlern und Beratern beinhaltet einige der weltweit führenden Autoritäten auf den Gebieten der Echtzeit-PCR und der DNA-Forschung. Jedes unserer Assays wird nicht von einem Computeralgorithmus, sondern von einem unserer Experten persönlich entwickelt.

Natürlich bietet die Entwicklungsarbeit am Computer entscheidende Vorteile. Sie ist deshalb fester Bestandteil unserer Entwicklungsverfahren. Wir nutzen eine an unsere Bedürfnisse angepasste Version des „Beacon Designer“ für unsere Entwicklungsarbeit am Computer. Bei der Software handelt es sich um die führende Software für die Entwicklung von Echtzeit-PCR Primern. Zusammen mit „Beacon Designer“ nutzen wir die beste verfügbare DNA-Analyse Software (Visual OMP) zur rechnergestützten Modellierung der thermodynamischen Eigenschaften jeder von uns entwickelten Echtzeit-PCR Sonde. Es handelt sich hierbei um die beste und ausführlichste Methode um noch vor der Synthese sicherzustellen, dass jede Sonde über die optimalen Eigenschaften verfügt.

Ausführliche Informationen über Beacon Designer finden Sie auf der Homepage von Beacon Designer (hier klicken)

Unser professionelles Entwicklungsverfahren beinhaltet folgende Schwerpunkte:

1) Primerspezifizität
Die wichtigste Eigenschaft eines qualitative hochwertigen Echtzeit-PCR Assay ist es, nur rein einziges Zielgen nachzuweisen. Während der Entwicklung überprüfen wir unsere Primer mit der NCBI Datenbank, um sicherzustellen, dass im Laufe der Echtzeit-PCR Reaktion einzig das gewünschte Zielgen amplifiziert wird. Anschließend testen wir unsere Primer an cDNA aus biologischen Quellen, um deren Leistungsfähigkeit zu kontrollieren.